El parido civil unido al Constitucional , lo lanzó de candidato para las elecciones de 1908 ,
de las cuales salió ganador asumiendo el poder el 24 de setiembre de este mismo año .
Leguia mostró como presidente una clara tendencia personalista y
autoritaria que lo llevó a disctanciarse de su propio partido.
Muchos jovenes intelectuales como José de la Riva -Aüero y Victor Andres Belaunde
lo combatieron. Los partidariso de Nicolas de Pierola tampoco lo soportaron .
Esta oposición dio origen al movimiento revolucionario de Carlos E Isaías de Piérola el 29 de mayo de 1909 ,
quienes apresaron a Leguía y exigieron su renuncia ,
la que no se produjo gracias al rescate del presidente.
Leguia afronto una crisis economica que obligó a realizar varios préstamos en el exterior se produjeron conflictos con Ecuador,Colombia,Chile,Bolivia y Brazil por limites territoriales.
El 19 de agosto de 1912 fue elegido presidente Guillermo Billinghurst y Leguia le entregó el mando el 29 de setiembre de 1912